宇宙发生了异变，新的强敌出现！许多不该出现的凶恶怪兽和外星人纷纷出现！有人在偷偷谋划一场巨大的阴谋，如今，阴谋渐渐浮出水面。众多奥特战士们联手，前来解开谜团的真相。

本作品讲述的是2013年所播出的《银河奥特曼》结束两年后的世界。在故事当中将会出现为了应对不寻常现象、防备危机而新设立的特别搜查队“UGP”。